Biološki uvidi iz multi-omske analize 31 genomskog lokusa rizika za poteškoće sa sluhom odraslih.
PLoS genetics
Sažetak istraživanja
Starostno oštećenje sluha (ARHI), jedno od najčešćih medicinskih stanja, snažno je nasljedno, ali njegovi genetski uzroci ostaju uglavnom nepoznati. Proveli smo meta-analizu zbirne statistike GWAS-a iz više osobina povezanih sa sluhom u UK Biobank (n = do 330,759) i identificirali 31 značajan lokus rizika u cijelom genomu za samoprijavljene poteškoće sa sluhom (p < 5x10-8), od kojih osam nije bilo objavljeno u literaturi koja je prethodno bila objavljena. Istraživali smo regulatornu i ćelijsku specifičnu ekspresiju za ove lokuse generiranjem mRNA-seq, ATAC-seq i jednoćelijske RNA-sekve iz stanica u pužnici miša. Geni povezani sa rizikom bili su najjače obogaćeni za ekspresiju u ćelijama epitela kohleara, kao i za gene povezane sa senzornom percepcijom i poznatim Mendelovim genima gluvoće, podržavajući njihovu relevantnost za slušnu funkciju. Regije ljudskog genoma homologne otvorenom hromatinu u epitelnim ćelijama miša su bile snažno obogaćene za nasledni rizik za poteškoće sa sluhom, čak i nakon prilagođavanja za osnovne efekte evolucione konzervacije i nespecifične regulatorne regione ćelijskog tipa. Epigenomsko i statističko fino mapiranje najsnažnije je podržavalo 50 potencijalnih rizičnih gena. Od njih, 39 je bilo snažno izraženo u pužnici miša, a 16 je obogaćeno specifično u senzornim ćelijama dlake. Ovi rezultati otkrivaju nove lokuse rizika i gene rizika za poteškoće sa sluhom i ukazuju na važnu ulogu izmijenjene regulacije gena u čulnom epitelu pužnice.
Prikaži originalni naslov i sažetak na engleskom
Biological insights from multi-omic analysis of 31 genomic risk loci for adult hearing difficulty.
Age-related hearing impairment (ARHI), one of the most common medical conditions, is strongly heritable, yet its genetic causes remain largely unknown. We conducted a meta-analysis of GWAS summary statistics from multiple hearing-related traits in the UK Biobank (n = up to 330,759) and identified 31 genome-wide significant risk loci for self-reported hearing difficulty (p < 5x10-8), of which eight have not been reported previously in the peer-reviewed literature. We investigated the regulatory and cell specific expression for these loci by generating mRNA-seq, ATAC-seq, and single-cell RNA-seq from cells in the mouse cochlea. Risk-associated genes were most strongly enriched for expression in cochlear epithelial cells, as well as for genes related to sensory perception and known Mendelian deafness genes, supporting their relevance to auditory function. Regions of the human genome homologous to open chromatin in epithelial cells from the mouse were strongly enriched for heritable risk for hearing difficulty, even after adjusting for baseline effects of evolutionary conservation and cell-type non-specific regulatory regions. Epigenomic and statistical fine-mapping most strongly supported 50 putative risk genes. Of these, 39 were expressed robustly in mouse cochlea and 16 were enriched specifically in sensory hair cells. These results reveal new risk loci and risk genes for hearing difficulty and suggest an important role for altered gene regulation in the cochlear sensory epithelium.
Izvorni podaci
- DOI
- 10.1371/journal.pgen.1009025
- PMID
- 32986727
- PMCID
- PMC7544108
- Provjereno
- 2026-07-26
Naslov i sažetak prevedeni su automatski i prijevod može sadržavati netačnosti ili neprecizne stručne izraze. Za sve detalje, citiranje i medicinsko tumačenje pregledajte originalnu englesku verziju članka. Ne donosite zdravstvene odluke samo na osnovu ovog prijevoda.
Pregledaj originalni članak na engleskom