Nedavni napredak u epidemiologiji zasnovanoj na otpadnim vodama za nadzor COVID-19: sistematski pregled analitičkih procedura i epidemiološkog modeliranja.
The Science of the total environment
Sažetak istraživanja
Svjetska zdravstvena organizacija je 11. marta 2020. godine proglasila pandemijom bolest koronavirusa 2019 (COVID-19), čiji je uzročnik Teški akutni respiratorni sindrom Coronavirus 2 (SARS-CoV-2). Ovaj virus se pretežno prenosi respiratornim kapljicama i izlučuje se putem sputuma, pljuvačke, urina i stolice. Epidemiologija zasnovana na otpadnim vodama (WBE) je bila u mogućnosti da prati cirkulaciju virusnih patogena u populaciji. Ovaj alat zahtijeva i rad u laboratoriji i računarski rad da bi bio smislen za, između ostalog, predviđanje izbijanja. U tom kontekstu, predstavljamo sistematski pregled koji organizira i raspravlja o laboratorijskim procedurama za kvantifikaciju SARS-CoV-2 RNK iz matrice otpadnih voda, zajedno sa tehnikama modeliranja primijenjenim na razvoj WBE-a za nadzor COVID-19.
Cilj ovog pregleda je da se predstavi trenutna panorama operativnih aspekata WBE, kao i da se identifikuju trenutni izazovi u vezi sa tim. Naš pregled je obavljen na ponovljiv način slijedeći smjernice Preferred Reporting Items za sistematske preglede i meta-analize (PRISMA) za sistematske preglede. Identificirali smo nedostatak standardizacije u analitičkim procedurama otpadnih voda. Bez obzira na to, pristup lančane lančane reakcije reverzne transkripcije (RT-qPCR) bio je najčešće prijavljivana tehnika koja se koristila za otkrivanje i kvantificiranje virusne RNK u uzorcima otpadnih voda. Kao pogodnija matrica uzorka, predlažemo da se čvrsti dio otpadne vode uzme u obzir u budućim istraživanjima zbog njenog većeg virusnog opterećenja u odnosu na tečnu frakciju. Što se tiče epidemiološkog modeliranja, pristup zasnovan na podacima dosljedno se koristio za predviđanje varijabli povezanih s epidemijama. Budući napori bi također trebali biti usmjereni ka razvoju brzih, ekonomičnijih, prenosivih i preciznijih uređaja za detekciju.
Prikaži originalni naslov i sažetak na engleskom
Recent progress on wastewater-based epidemiology for COVID-19 surveillance: A systematic review of analytical procedures and epidemiological modeling.
On March 11, 2020, the World Health Organization declared the coronavirus disease 2019 (COVID-19), whose causative agent is the Severe Acute Respiratory Syndrome Coronavirus 2 (SARS-CoV-2), a pandemic. This virus is predominantly transmitted via respiratory droplets and shed via sputum, saliva, urine, and stool. Wastewater-based epidemiology (WBE) has been able to monitor the circulation of viral pathogens in the population. This tool demands both in-lab and computational work to be meaningful for, among other purposes, the prediction of outbreaks. In this context, we present a systematic review that organizes and discusses laboratory procedures for SARS-CoV-2 RNA quantification from a wastewater matrix, along with modeling techniques applied to the development of WBE for COVID-19 surveillance. The goal of this review is to present the current panorama of WBE operational aspects as well as to identify current challenges related to it. Our review was conducted in a reproducible manner by following the Preferred Reporting Items for Systematic Reviews and Meta-Analyses (PRISMA) guidelines for systematic reviews. We identified a lack of standardization in wastewater analytical procedures. Regardless, the reverse transcription-quantitative polymerase chain reaction (RT-qPCR) approach was the most reported technique employed to detect and quantify viral RNA in wastewater samples. As a more convenient sample matrix, we suggest the solid portion of wastewater to be considered in future investigations due to its higher viral load compared to the liquid fraction. Regarding the epidemiological modeling, the data-driven approach was consistently used for the prediction of variables associated with outbreaks. Future efforts should also be directed toward the development of rapid, more economical, portable, and accurate detection devices.
Izvorni podaci
- DOI
- 10.1016/j.scitotenv.2023.162953
- PMID
- 36948304
- PMCID
- PMC10028212
- Provjereno
- 2026-07-26
Naslov i sažetak prevedeni su automatski i prijevod može sadržavati netačnosti ili neprecizne stručne izraze. Za sve detalje, citiranje i medicinsko tumačenje pregledajte originalnu englesku verziju članka. Ne donosite zdravstvene odluke samo na osnovu ovog prijevoda.
Pregledaj originalni članak na engleskom