Dijagnostička točnost metagenomskog sekvenciranja nove generacije u dijagnostici zaraznih bolesti: meta-analiza.
Scientific reports
Sažetak istraživanja
Mnoge uobičajene patogene je teško ili nemoguće otkriti korištenjem konvencionalnih mikrobioloških testova. Međutim, čini se da je brza i neciljana priroda metagenomskog sekvenciranja sljedeće generacije (mNGS) obećavajuća alternativa. Izvršiti sistematski pregled i meta-analizu dokaza o dijagnostičkoj tačnosti mNGS-a kod pacijenata sa zaraznim bolestima. Izvršena je elektronska pretraga literature baza podataka Embase, PubMed i Scopus. Kvalitet je ocjenjivan pomoću alata za procjenu kvaliteta dijagnostičke tačnosti studija-2. Izračunate su zbirne radne karakteristike prijemnika (sROC) i površina ispod krive (AUC); U slučajevima heterogenosti korišten je model slučajnih efekata. Ukupno 20 radova bilo je prihvatljivo za uključivanje i sintezu. Osetljivost i specifičnost dijagnostičkog mNGS-a bile su 75% i 68%, respektivno. AUC iz SROC-a bio je 85%, što odgovara odličnim performansama. mNGS je pokazao zadovoljavajuće dijagnostičke performanse za infekcije i dao je ukupnu stopu otkrivanja superiornu u odnosu na konvencionalne metode.
Prikaži originalni naslov i sažetak na engleskom
Diagnostic accuracy of metagenomic next-generation sequencing in diagnosing infectious diseases: a meta-analysis.
Many common pathogens are difficult or impossible to detect using conventional microbiological tests. However, the rapid and untargeted nature of metagenomic next-generation sequencing (mNGS) appears to be a promising alternative. To perform a systematic review and meta-analysis of evidence regarding the diagnostic accuracy of mNGS in patients with infectious diseases. An electronic literature search of Embase, PubMed and Scopus databases was performed. Quality was assessed using the Quality Assessment of Diagnostic Accuracy Studies-2 tool. Summary receiver operating characteristics (sROC) and the area under the curve (AUC) were calculated; A random-effects model was used in cases of heterogeneity. A total of 20 papers were eligible for inclusion and synthesis. The sensitivity and specificity of diagnostic mNGS were 75% and 68%, respectively. The AUC from the SROC was 85%, corresponding to excellent performance. mNGS demonstrated satisfactory diagnostic performance for infections and yielded an overall detection rate superior to conventional methods.
Izvorni podaci
- DOI
- 10.1038/s41598-022-25314-y
- PMID
- 36470909
- PMCID
- PMC9723114
- Provjereno
- 2026-07-26
Naslov i sažetak prevedeni su automatski i prijevod može sadržavati netačnosti ili neprecizne stručne izraze. Za sve detalje, citiranje i medicinsko tumačenje pregledajte originalnu englesku verziju članka. Ne donosite zdravstvene odluke samo na osnovu ovog prijevoda.
Pregledaj originalni članak na engleskom