Polimorfizmi K13-propelerskog gena u populaciji parazita Plasmodium falciparum u zemljama pogođenim malarijom: sistematski pregled prevalencije i faktora rizika.
Malaria journal
Sažetak istraživanja
Pozadina Efikasnost artemisinina (ART) agenasa, kritičnog elementa trenutnih napora za kontrolu malarije, ugrožena je pojavom i širenjem rezistencije. Mutacije gena pfkelch13 povezane sa otpornošću na ART evoluirale su u jugoistočnoj Aziji (SEA). k13 mutacije čija uloga u rezistenciji na ART ostaje nepoznata, kasnije su se pojavile nezavisno u svim regijama zahvaćenim malarijom.
Cilj ovog sistematskog pregleda bio je da se utvrdi prevalencija i identifikuju faktori rizika mutacija Plasmodium falciparum k13 u zemljama sa endemom malarije.
Metode Elektronska pretraga studija od 2014. do danas urađena je u MEDLINE-u putem baza podataka PubMED, SCOPUS, EMBASE i LILACS/VHL. Korišteni su termini mreže i Booleovi operatori (AND, OR). Dva bibliotekara su samostalno izvršila ovu pretragu (RS i AK). Članci su pregledani za uključivanje pomoću a priori postavljenih kriterijuma u skladu sa smernicama PRISMA-P i STREGA. Tri nezavisna recenzenta (NL, BB i OM) su izdvojila podatke. Analiza podataka je obavljena u softveru Open Meta Analyst. Korištena je analiza slučajnih efekata (DL) i heterogenost je utvrđena korištenjem I 2 -statistike.
Rezultati Ukupno 482 članka je preuzeto iz Pubmed = 302, Lilacs/Vhl = 50, Embase = 80 i Scopus = 37; Bibliografija/ostale pretrage = 13, od kojih 374 nisu ispunile kriterijume za uključivanje. Ukupna prevalencija jednonukleotidnih polimorfizama (SNP) u genu pfkelch13 bila je 27,6% (3694/14,827) (95% CI 22,9%, 32,3%). Analiza podgrupa je pokazala da je ukupna prevalencija nesinonimnih SNP-a u genu pfkelch13 veća, 45,4% (95% CI 35,4%, 55,3%) u jugoistočnoj Aziji, za razliku od 7,6% (95% CI 5,6%, 9,5%) u afričkom regionu. Ukupno je identifikovano 165 nezavisnih k13 mutacija širom sveta zahvaćenih malarijom. Ukupno 16 nevalidiranih k13 mutacija bilo je povezano sa povećanim poluživotom klirensa ART parazita (t 1/2 > 5 h). Većina, 45,5% (75/165), mutacija je prijavljena u pojedinačnim infekcijama parazitima P. falciparum. Od 165 k13-mutacija, više od polovine je prijavljeno kao novi aleli. Identificirano je dvadeset (20) mutacija bez propelera u genu pfkelch13.
Zaključak Ovaj pregled je identifikovao pojavu potencijalne rezistencije na ART koja posreduje k13 mutacije u afričkom regionu. Raznolikost mutacija gena pfkelch13 najveća je u afričkom regionu u poređenju sa SEA. Mutacije izvan pfkelch13 propelerske regije povezane sa povećanim poluživotom klirensa ART parazita javljaju se u regijama zahvaćenim malarijom.
Prikaži originalni naslov i sažetak na engleskom
K13-propeller gene polymorphisms in Plasmodium falciparum parasite population in malaria affected countries: a systematic review of prevalence and risk factors.
Background Efficacy of artemisinin (ART) agents, a critical element of current malaria control efforts is threatened by emergence and spread of resistance. Mutations in pfkelch13 gene associated with ART-resistance evolved in Southeast Asia (SEA). k13 mutations whose role in ART-resistance remains unknown, have subsequently emerged independently across all malaria-affected regions. The aim of this systematic review was to determine the prevalence and identify risk factors of Plasmodium falciparum k13 mutations in malaria-endemic countries.
Methods An electronic search of studies from 2014 to date was done in MEDLINE via PubMED, SCOPUS, EMBASE and LILACS/VHL databases. Mesh terms and Boolean operators (AND, OR) were used. Two librarians independently conducted this search (RS and AK). The articles were screened for inclusion using a priori criteria set following PRISMA-P and STREGA guidelines. Three independent reviewers (NL, BB, and OM) extracted the data. Data analysis was performed in Open Meta Analyst software. Random effects analysis (DL) was used and heterogeneity established using I 2 -statistic.
Results A total of 482 articles were retrieved from Pubmed = 302, Lilacs/Vhl = 50, Embase = 80, and Scopus = 37; Bibliography/other searches = 13, of which 374 did not meet the inclusion criteria. The aggregate prevalence of single nucleotide polymorphisms (SNPs) in pfkelch13 gene was 27.6% (3694/14,827) (95% CI 22.9%, 32.3%). Sub-group analysis showed that aggregate prevalence of non-synonymous SNPs in pfkelch13 gene was higher, 45.4% (95% CI 35.4%, 55.3%) in Southeast Asia as opposed to 7.6% (95% CI 5.6%, 9.5%) in the African region. A total of 165 independent k13 mutations were identified across malaria-affected regions globally. A total of 16 non-validated k13 mutations were associated with increased ART parasite clearance half-life (t 1/2 > 5 h). The majority, 45.5% (75/165), of the mutations were reported in single P. falciparum parasite infections. Of the 165 k13-mutations, over half were reported as new alleles. Twenty (20) non-propeller mutations in the pfkelch13 gene were identified.
Conclusion This review identified emergence of potential ART-resistance mediating k13 mutations in the African region. Diversity of mutations in pfkelch13 gene is highest in African region compared to SEA. Mutations outside the pfkelch13 propeller region associated with increased ART parasite clearance half-life occur in malaria-affected regions.
Izvorni podaci
- DOI
- 10.1186/s12936-019-2701-6
- PMID
- 30846002
- PMCID
- PMC6407282
- Provjereno
- 2026-07-26
Naslov i sažetak prevedeni su automatski i prijevod može sadržavati netačnosti ili neprecizne stručne izraze. Za sve detalje, citiranje i medicinsko tumačenje pregledajte originalnu englesku verziju članka. Ne donosite zdravstvene odluke samo na osnovu ovog prijevoda.
Pregledaj originalni članak na engleskom